Genotipado

Hibridación y Escaneo de Microarreglos para Análisis de SNP´s empleando el sistema HiScan de Illumina.

Información del Servicio

El Genotipado de SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) con tecnología de microarrays (BeadChips) y el escaneo de los datos con el sistema HiScan de Illumina pueden proporcionar información sobre la variabilidad genética entre poblaciones de individuos a gran escala, así como también la susceptibilidad y variantes causales a una enfermedad.

La variedad de arreglos disponibles abren las posibilidades a una amplia gama de aplicaciones:

  • Genotipado de genomas completos
  • Microarreglos por diseño
  • Predicción genética
  • Estudio de variantes agrícolas y agronómicas
  • Estudios GWAS
  • Detección de enfermedades
  • Estudio de variantes poco comunes
  • Apoyo en procesos de control de calidad
  • Análisis Forenses

MICROARREGLOS PARA GENOTIPADO Y ANALISIS EPIGENETICOS
HUMANOCANINOBOVINOOVINOPORCINOCAMARÓNMAÍZPERSONALIZADO

Infinium Core-24 KIT
Microarreglo económico para genotipado a gran escala de humanos, con capacidades de procesamiento de alto rendimiento, y la opción de agregar hasta 300,000 marcadores semi-personalizados.

Infinium CoreExome-24 KIT
Microarreglo de ADN que genera una información muy amplia de SNPs y variantes genéticas para estudios genéticos, muy utilizados para estudios de genotipado a gran escala.

Infinium Exome-24 KIT
Ofrece una cobertura excepcional de posibles variantes funcionales en el exoma que representan diversas poblaciones y un rango de condiciones comunes.

Infinium Global Screening Array-24 v1.0 Kit
Arreglo para genotipado de nueva generación para estudios géneticos a escala poblacional con una selección de variantes útiles para la investigación en medicina de precisión.

Infinium InmunoArray-24 v2 BeadChip Kit
Matriz para genotipado de nueva generación dirigido a detectar variaciones genéticas en el sistema inmunológico.

InfiniumMethylationEPIC Kit
Arreglo para análisis de perfiles de metilación con una cobertura sin precedentes de las islas CpG, genes y potenciadores. Uso para estudios de asociación de todo el epigenoma.

Infinium multi-Ethinic AMR/AFR-8 Kit
Arreglo para entender enfermedades complejas en diversas poblaciones humanas, enfocadas en poblaciones hispanas y afroamericanas.

Infinium multi-Ethinic EUR/EAS/SAS-8 Kit
Arreglo para entender enfermedades complejas en diversas poblaciones humanas, centradas en poblaciones europeas, asiáticas orientales y del sur de Asia.

Infinium multi-Ethinic Global-8 Kit
Arreglo para entender enfermedades complejas en diversas poblaciones humanas.

Infinium Omni2.5-8 Kit
Arreglo con ~ 2,5 millones de marcadores, con capacidad adicional de marcador personalizado y ofrece tasas de cobertura genómica excepcionales entre diversas poblaciones.

Infinium Omni2.5Exome-8 Kit
Cobertura exhaustiva y contenido funcional exónico para genotipificación de nueva generación, GWAS y análisis CNV.

Infinium Omni5-4Kit
Arreglo para 4 muestras, optimizada para el genotipo de todo el genoma y estudios CNV, cubre> 4.3 millones de variantes.

Infinium Omni5Exome-4 Kit
Arreglo que cubre > 4.3 millones de variantes de genoma completo con hasta 1% de frecuencia del alelo menos común (MAF), además de nuevas variantes funcionales exónicas.

Infinium OmniExpress-24 Kit
Arreglo para 24 muestras que permite poderosos estudios de asociación de todo el genoma humano (GWAS).

Infinium OmniExpressExome-8 Kit
Para descubrir nuevas asociaciones de rasgos y enfermedades con etiquetas optimizadas SNP y contenido exónico funcional.

Infinium OmniZhonHua-8 Kit
Utilizado para avanzar en el Estudio de Asociación del Genoma Completo (GWAS) de la población China. Este microarray proporciona cobertura de variación común, intermedia y rara específica a las poblaciones chinas.

Infinium OncoArray-500K BeadChip
Arreglo de alta densidad que permite investigar la predisposición y el riesgo al cáncer.

Infinium PsychArray-24 Kit
Arreglo de alta densidad para escalar los estudios genéticos enfocados a la a predisposición y riesgo psiquiátrico.

Infinium QC Array-24 Kit
Microarreglo de alto rendimiento y costo rentable para control de calidad, seguimiento Genotipado de alto rendimiento y rentable para el control de calidad, el seguimiento y aplicaciones de estratificación, incluido el biobanco.

CanineHD Whole-Genome Genotyping BeadChip
Arreglo para el genotipado de cualquier raza de perro doméstico; ofrece una amplia densidad de SNP para la asociación dentro de la raza y los estudios CNV.

BovineHD DNA Analysis Kit
Conjunto genómico de genotipos bovinos, cuenta con más de 777.000 SNPs y es compatible con cualquier raza de ganado vacuno o lechero.

BovineLD Genotyping BeadChip
Arreglo para extender la selección genómica a todo el rebaño con contenido escalable a un precio económico, con el fin de entender el impacto de la genética en la producción de leche, reproducción, salud y más.

BovineSNP50 v3 DNA Analysis BeadChip
Arreglo de alta densidad para genotipado de ganado bovino útil para la caracterización genómica de los principales tipos de ganado lechero y bovino de carne. Contiene 53,714 SNP altamente informativos.

OvineSNP50 DNA Analysis Kit
Arreglo con más de 54,241 sondas de SNP uniformemente espaciados para estudios de asociación del genoma en general, la selección de todo el genoma y ​​la determinación del mérito genético.

PorcineSNP60 DNA Analysis Kit v2
Arreglo con más de 64.000 SNPs uniformemente distribuidos para el análisis de variación genética de múltiples razas porcinas.

Infinium ShrimpLD-24 BeadChip
Arreglo para el genotipado con gran potencial para acanzar en los programas de cría acuícola de camarón blanco del Pacífico.

MaizeLD BeadChip Kit
Arreglo para la evaluación de variedades derivas y aplicaciones de mejoramiento de maíz. Las muestras utilizadas para el arreglo, incluyen el panel de Ley de Protección de Variedades Vegetales.

MaizeSNP50 DNA Analysis Kit
Arreglo que permite el análisis de variantes genéticas a través de líneas de maíz. Incluye más de 50.000 marcadores validados de la referencia de maíz B73.

Infinium XT
Infinium XT es una solución integral de microarrays que permite genotipado a escala de producción de hasta 50.000 variantes personalizadas de una o varias especies.

Infinium iSelect HD and HTS Custom Genotyping BeadChips
Cuestionamiento virtual para cualquier blanco y cualquier especie, con el fin de crear un arreglo de necesidades únicas para un estudio.


Descripción del Servicio
  • Cuantificación del ADN utilizando la química Pico-Green.
  • Análisis del gel de ADN para la evaluación de la integridad del material proporcionado.
  • Procesamiento de muestras para el genotipado de acuerdo con el protocolo Infinium de Illumina.
  • Escaneo de las laminillas en el sistema HiScan de Illumina.
  • Entrega de datos crudos (tabla Excel con los SNPs identificados por muestra), más archivos sin filtrar .ped y .map.
Si el usuario está interesado en que las muestras de ADN a partir de saliva de humano sean extraídas en el Laboratorio de Servicios Genómicos por favor entrar a la liga:

Requerimientos de la Muestra
  • Las muestras de ADN deberán entregarse en placas de 96 pozos a una concentración de 70 ng/μL en un volumen de 40 µL cada una, resuspendidas en buffer TE (10mM Tris  pH=8.0 / 1nM EDTA) o agua libre de nucleasas. No se debe utilizar inhibidor enzimático (no DEPC) para la preparación de las muestras.
  • La placa debe venir perfectamente sellada con tapete adhesivo de plástico.
  • Las muestras solo serán recibidas, si van acompañadas de la solicitud del servicio, previamente llenada con los datos requeridos y un archivo de Excel con la información de las muestras a procesar.

Entrega de Resultados

Los resultados del escaneo, todos los archivos y la información generada por el HiScan será transferida al usuario por medio de la liga:

Formatos de Solicitud del Servicio

Costos y Contacto

Para mayor información sobre el servicio y cotización, por favor comunicarse a:

IA. María de Jesús Ortega Estrada
maría.ortega@cinvestav.mx
Tel. +52 (462) 166-3000 Ext(s). 3023, 3121, 3130

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