La secuenciación por síntesis SBS, es una más de las tecnologías de secuenciación masiva de nueva generación que utilizan la amplificación clonal in vitro.
Los fragmentos a secuenciar son preparados con adaptadores en los extremos, para permitir que sus cadenas desnaturalizadas puedan unirse a una superficie sólida y así poder ser enriquecidas por medio de una amplificación tipo puente, generando clusters de cadenas del mismo fragmento, con el fin de amplificar la señal generada por los nucleótidos fluorescentes incorporados a la cadena en crecimiento y así puedan ser detectados por una cámara, esto durante un proceso cíclico que permite alargar las lecturas dependiendo de la plataforma seleccionada.
Aplicaciones
- Genómica
- Transcriptómica (RNA-Seq)
- Epigenética (micro RNA´s, small RNA, regiones metiladas)
- ChIP-Seq
- Metagenómica (Shot-gun, 16S, ITS)
- Secuenciación de Amplicones
- Secuenciación de zonas enriquecidas para detección de enfermedades
- Secuenciación de Exoma
- Genotyping by Sequencing (GBS)
Equipo
Formato | No. de lecturas por Placa |
Capacidad por corrida (bases) |
1x75 High | ±380,000,000 | 25,000,000,000 |
2x75 High | ±380,000,000 x 2 | 50,000,000,000 |
1x130High | ±380,000,000 x 2 | 50,000,000,000 |
2x150High | ±380,000,000 x 2 | 110,000,000,000 |
2x75 Mid | ±110,000,000 x 2 | 18,000,000,000 |
1x130 Mid | ±110,000,000 x 2 | 18,000,000,000 |
2x150 Mid | ±110,000,000 x 2 | 35,000,000,000 |
Formato | No. de lecturas por corrida | Capacidad por corrida (bases) |
1x50 | ±11,000,000 x 1 | 730,000,000 |
2x75 | ±20,000,000 x 2 | 3,100,000,000 |
2x150 | ±11,000,000 x 2 | 4,300,000,000 |
2x250 | ±11,000,000 x 2 | 7,200,000,000 |
2x300 | ±20,000,000 x 2 | 12,500,000,000 |
Descripción del Servicio
Preparación de las bibliotecas a partir de DNA, Amplicones (y/o productos de PCR), o bien RNA (o sus variantes).
- Amplificación clonal para la generación de cluster.
- Corrida de secuenciación.
- Entrega de resultados de las lecturas y sus calidades generados en archivos FASTQ y FastQC.
- Análisis Bioinformático (opcional)
Requisitos de la Muestra
- Para DNA genómico se requieren 2 μg diluido en agua, integro y limpio, a una concentración no menor de 200ng/μl ó puede enviarse la muestra liofilizada.
- Para productos de PCR (Amplicones) se requieren 500 ng de la muestra, a una concentración no menor de 25ng/μl.
- Para productos de PCR (Amplicones) se requieren 500 ng de la muestra, a una concentración no menor de 25ng/μl.
- También se ofrece el servicio de generación de amplicones, favor de contactarse.
El usuario deberá proveer evidencia de que el cociente DO 260/280 y DO 260/230 >= 1.8. - Incluir fotografía ó gráfica que muestre la calidad e integridad de la muestra, así como la foto de un gel.
- Para hacer análisis transcriptómicos se requieren 4 μg de RNA total, integro y limpio.
- Para análisis de micro RNA´s y RNA´s pequeños se requiere 2 μg total.
- El usuario deberá proveer evidencia de que el cociente DO 260/280 es 2.
- Es necesario que el Valor Integral (RIN) sea mayor o igual a 8.
- El usuario deberá proveer 1 foto del gel para verificar la Integridad de la muestra.
- La muestra de RNA deberá entregarse en agua, congelada y a una concentración no menor de 50 ng/μl.
Entrega de Resultados
Toda la información será enviada al cliente a través de nuestro sitio de entrega de resultados, con una clave de usuario y contraseña:
Formatos
Costos y Contacto